Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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