Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms