Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4EBP1P1-201ENST00000557776 341 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ABBA01040607.1-201ENST00000640749 321 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC23-201ENST00000262074 3316 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP3-201ENST00000336119 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB24-201ENST00000230122 5519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590132.1-201ENST00000639602 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A14-201ENST00000273173 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL5-221ENST00000557636 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms