Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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