Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNCBQ16143 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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