Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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