Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCINQ13939 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCINQ13939 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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CCINQ13939 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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CCINQ13939 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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