Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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