Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CSTF3Q12996 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CSTF3Q12996 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CSTF3Q12996 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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