Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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