Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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