Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
AMER3Q8N944 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms