Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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