Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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