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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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403 nt
TSL 2
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
MTND5P13-201
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1079 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
AC087242.1-201
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572 nt
TSL 4
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
AC011611.2-201
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358 nt
TSL 3
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
MIR3660-201
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BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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360 nt
BASIC
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
AC087045.1-201
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.23
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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□□□□□ -2.24
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Q16143
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
MTCO1P44-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC020550.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RPL39P29-201
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□□□□□ -2.24
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Q16143
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SNCB
Q16143
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SNCB
Q16143
RPS26P55-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC108752.1-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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359 nt
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC026780.2-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AKIRIN2P1-201
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352 nt
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC110760.3-202
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC091944.1-201
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC006518.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC138915.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC011933.3-201
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372 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
MIR4303-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
uc_338.12-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
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Q16143
MIR6134-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AL445264.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RMDN2-203
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TSL 2
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
SLC10A5P1-201
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1306 nt
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
NF1-214
ENST00000490416
1329 nt
TSL 3
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
ZBTB8OS-201
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312 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
SNORA7.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RNU6-457P-201
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AL139397.2-201
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772 nt
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
TPMTP2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
USP9YP26-201
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BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AL353743.2-202
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TSL 3
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC092001.1-201
ENST00000453012
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
MEMO1P3-201
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302 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC108729.1-201
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BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RNU5B-3P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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482 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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445 nt
TSL 3
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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320 nt
TSL 4
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC008764.5-201
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TSL 5
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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ENST00000625002
298 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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ENST00000624776
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APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
FAM135A-203
ENST00000370479
5930 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RNU6-343P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RNU4-91P-201
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BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
SNORA48.1-201
ENST00000390879
135 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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ENST00000417476
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TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
CST2P1-201
ENST00000425770
87 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
TRIM60P13-201
ENST00000432350
1283 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
COX7BP2-201
ENST00000437976
242 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
MRPL42P4-201
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443 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AL353780.1-201
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458 nt
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
LINC01075-201
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370 nt
TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC108517.1-201
ENST00000512546
327 nt
TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RN7SKP219-201
ENST00000516825
296 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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156 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC107882.1-201
ENST00000530837
477 nt
TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC098850.3-201
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771 nt
TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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TSL 3
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
MIR4295-201
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BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
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BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
AC091057.3-201
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733 nt
BASIC
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□□□□□ -2.24
SNCB
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BASIC
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Q16143
RNU6-1187P-201
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BASIC
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Q16143
RNU6-1032P-201
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BASIC
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Q16143
RNU6-611P-201
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BASIC
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Q16143
RPL23AP36-201
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BASIC
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Q16143
RPL7P55-201
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BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
RPL36AP21-201
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BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
HYDIN2-201
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TSL 4
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
SNCB
Q16143
LINC02472-201
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.24
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Q16143
RNU7-40P-201
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□□□□□ -2.24
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TSL 3
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□□□□□ -2.24
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Q16143
AC087441.2-201
ENST00000529141
262 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
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