Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms