Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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