Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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