Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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