Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms