Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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