Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NME3Q13232 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NME3Q13232 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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