Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
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