Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTDSPL2Q05D32 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms