Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms