Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRGP23470 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRGP23470 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRGP23470 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRGP23470 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRGP23470 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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