Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms