Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMIEQ8NEW7 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TMIEQ8NEW7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms