Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms