Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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