Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PPP1R3AQ16821 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPP1R3AQ16821 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms