Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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