Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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USF2Q15853 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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