Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR6A1Q15406 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms