Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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