Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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