Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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