Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MTMR3Q13615 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms