Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
STRN3Q13033 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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