Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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