Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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RTL8BQ17RB0 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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