Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HIF1AQ16665 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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