Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms