Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZFHX3Q15911 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms