Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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