Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD8Q15843 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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