Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCOA1Q15788 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCOA1Q15788 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms