Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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