Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LAPTM4AQ15012 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LAPTM4AQ15012 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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