Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CDH18Q13634 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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